Atalanta setzte seinen guten Saisonstart mit einem verdienten Champions-League-Sieg in Stuttgart fort.
Die Italiener hatten in der ersten Halbzeit mehr Ballbesitz, doch die beiden besten Chancen ließen die Gastgeber ungenutzt.
Zuerst köpfte Anthony Rouault aus kurzer Distanz über das Tor, bevor der ehemalige Stürmer von Brighton, Deniz Undav, ins Außennetz schoss, nachdem er hinter die Abwehr gerutscht war.
Allerdings startete die Serie-A-Mannschaft, die am Sonntag einen souveränen 3:0-Sieg gegen Neapel errungen hatte, in der zweiten Halbzeit vorne und ging durch Ademola Lookman in Führung.
Gian Piero Gasperinis Entscheidung, Charles De Ketelaere in der Halbzeitpause einzuwechseln, zahlte sich aus, als der Einwechselspieler seinen Mann besiegte, bevor er eine flache Flanke spielte, die Lookman ins Tor schoss.
Lookman, der letzte Saison im Europa-League-Finale einen Hattrick erzielte, hat in dieser Saison nun acht Tore in zwölf Spielen in allen Wettbewerben erzielt.
Stuttgart hätte fast sofort zurückgeschlagen, doch Ermedin Demirovic verfehlte das Tor aus wenigen Metern Entfernung, nachdem er einen Schnitt über das Tor gemacht hatte.
Die deutsche Mannschaft erhöhte den Druck, aber Atalanta sicherte sich den Sieg, als der eingewechselte Nicolo Zaniolo im Konter traf.
Atalanta, das in dieser Saison im Europapokal noch kein Gegentor kassiert hat, rückt nach vier Spielen mit acht Punkten auf den neunten Tabellenplatz vor, während Stuttgart mit vier Punkten auf den 25. Platz zurückfällt.
Am fünften Spieltag reist Stuttgart nach Belgrad, um gegen Crvena Zvezda anzutreten, während Atalanta in der Schweiz gegen die Young Boys antritt.